質(zhì)粒(plasmid)是一類獨(dú)立于宿主細(xì)胞染色體以外,能自主復(fù)制的遺傳單位,其常見的形式是細(xì)菌中環(huán)狀的雙鏈DNA分子。在當(dāng)代分子生物學(xué)和醫(yī)學(xué)的研究中,質(zhì)粒已被廣泛用作目的基因的載體。
圖1:質(zhì)粒的應(yīng)用(圖片來源于網(wǎng)絡(luò))
臨床級(jí)別的質(zhì)粒DNA的生產(chǎn),面臨的挑戰(zhàn)包括細(xì)菌宿主細(xì)胞污染物相關(guān)的去除,以及質(zhì)粒超螺旋和開環(huán)形式的分離。FDA建議質(zhì)粒DNA的污染物中,染色體DNA、RNA和蛋白質(zhì)的比重要控制在1%以內(nèi),超螺旋pDNA的比重控制在80%以內(nèi)。而一般而言,生物行業(yè)對于超螺旋質(zhì)粒水平的期望通常大于90%,通常高達(dá)95%。
堿裂解法是質(zhì)粒制備常用的方法之一,也是生產(chǎn)過程中重要的一環(huán),堿裂解的過程影響到后續(xù)質(zhì)粒的質(zhì)量。如在堿性溶液中長時(shí)間暴露,超螺旋DNA會(huì)產(chǎn)生開環(huán)結(jié)構(gòu),也會(huì)使細(xì)菌大腸桿菌基因組斷裂,帶來gDNA污染。所以在這個(gè)過程中,對于處理時(shí)間、剪切力和溶液混合效率等參數(shù)的掌握,尤為關(guān)鍵。
圖2:賽科成SKC400 200L混勻器
SKC400混勻器簡介
賽科成SKC400混勻器采用非介入的波浪式搖動(dòng)混合,通過控制擺動(dòng)速度、擺動(dòng)角度、擺動(dòng)時(shí)間等參數(shù)使溶液中的分子重新分布并均勻混合。該設(shè)備所配套的封閉式一次性儲(chǔ)液袋中,可分別預(yù)儲(chǔ)存三種不同料液,并用液壓桿進(jìn)行分隔。
在質(zhì)粒制備過程中,可以運(yùn)用SKC400混勻器進(jìn)行堿裂解。當(dāng)程序運(yùn)行時(shí),注入菌液,與溶液I進(jìn)行混合重懸;下一步將分隔溶液II的液壓桿提起,菌體在NaOH 和SDS溶液中裂解,蛋白質(zhì)與DNA發(fā)生變性;最后一步,分隔溶液III的液壓桿提起,溶液III與溶液II中和,質(zhì)粒DNA迅速復(fù)性,呈溶解狀態(tài),離心時(shí)留在上清中,由此完成了三種溶液的自混勻。
SKC400混勻器特點(diǎn)
● 模塊化設(shè)計(jì),可設(shè)置三級(jí)權(quán)限管理,支持?jǐn)?shù)據(jù)導(dǎo)出。
SKC400混勻器應(yīng)用
● 主要用于大規(guī)模質(zhì)粒裂解
● 半成品配制
SKC400混勻器技術(shù)參數(shù)
托盤大小 | 50L托盤 | 200L托盤 |
處理量 | 最大25L | 最大100L |
控制系統(tǒng) | 西門子PLC,彩色觸摸屏,以太網(wǎng)接口,USB接口 | |
混勻控制 | 可設(shè)定各階段混勻速度、角度、混勻時(shí)間、靜置時(shí)間,混勻結(jié)束后自動(dòng)停止。 | |
控制界面 | 具有混勻控制、報(bào)警、趨勢、校準(zhǔn)、設(shè)置等界面 | |
擺動(dòng)速度 | 1-40rpm | 2-25rpm |
擺動(dòng)角度 | 1-12° | 1-10° |
稱重模塊※ | 可根據(jù)需要選擇,可選稱重模塊 | |
SCADA軟件※ | 完全符合GMP/GAMP要求、包括三級(jí)權(quán)限、報(bào)警記錄、數(shù)據(jù)報(bào)表、審記追蹤等 | |
電源 | AC220V,50/60HZ,10A |
帶※表示有可選配項(xiàng)
參考文獻(xiàn):
Hitchcock, A., Sergeant, J., Rahman, S., Tharia, H.A., & Blom, H. (2010). Scale-Up of a Plasmid DNA Purification Process Use of a Commercial Resin to Produce GMP-Grade pDNA for Clinical Studies.
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